בנייתה הפיסית של המדרשה הייתה פרויקט ארוך טווח שהתבצע בעיקר על ידי משתתפי סמינרים של בנייה אקולוגית. המדרשה נבנתה ביעלון, ממזרח לקיבוץ, על גבעה הצופה אל נוף הרי אדום.

יעלון הייתה בעבר היאחזות נח"ל, והסבתה למדרשה הייתה פרויקט בנייה מורכב ומרתק: על בסיס התשתיות הקיימות הפכנו את המקום למתחם ירוק — תרתי משמע — הכולל בנייה בבאלות קש ובוץ, והסבתם של מבנים טרומיים ישנים לחדרי אירוח ידידותיים לסביבה, כולל גינות נוי ופיתוח סביבתי.

תהליך הבנייה שילב בין עקרונות של בנייה טבעית, עבודה שיתופית ולמידה חיה — ביטוי מוחשי לגישת המדרשה של חיבור בין רעיון למעשה ובין אדם לסביבתו.

המדרשה בנאות סמדר מקיימת סמינרים ומלווה קהילות, צוותים וקבוצות המעוניינים לעצור יחד במרחב בטוח וללמוד כיצד ניתן לקיים חיים של שיתוף פעולה, אמון ויחסים בריאים.

המשתתפים עוברים שינוי עמוק שאינו מתרחש באמצעות למידה עיונית, אלא דרך חוויה ישירה של התבוננות של כל אחד על עצמו, ומתוך כך — יציאה ליחסים של הקשבה, רגישות והבנה הדדית.

הקבוצות מתנסות באופן חי ומעשי בחיי יום־יום של שיתוף פעולה, שיח קשוב ועבודה משותפת במרחבי נאות סמדר — חוויה שמאפשרת התקרבות, הכרות מחודשת והשראה הדדית בקרב חברי הקבוצה, בלב השקט של המדבר.

המדרשה היא מרכז דינמי של התנסות, לימוד וחינוך בשאלות יסוד בקיום האנושי. היא מזמינה להשתתף בסמינרים חווייתיים של התבוננות, שיח ועשייה – בלב המדבר, כחלק מחיי הקהילה של נאות סמדר.

במדרשה מתקיימים סמינרים קצרים של מספר ימים לקבוצות ויחידים, וכן סמינרים מותאמים אישית – חוויה עמוקה של למידה, חקירה משותפת, עשייה ושיח, הנבנית בהתאם לצרכים ולאופי הייחודי של כל קבוצה.

גישת הלימוד במדרשה מבוססת על שלושה מרחבים עיקריים: האדם עם עצמו – התבוננות פנימית וקשב; האדם עם זולתו – יחסים, דיאלוג ושיתוף פעולה; ומרחב העבודה – התנסות מעשית המחברת בין מחשבה לעשייה.

המדרשה נבנתה ביעלון, ממזרח לקיבוץ נאות סמדר, על גבעה הצופה אל הרי אדום. תהליך הבנייה נעשה בשיטות אקולוגיות של קש ובוץ, בשילוב פיתוח סביבתי ונטיעות, תוך שיתוף משתתפי הסמינרים עצמם.

סמינר הקהילה הוא מרחב לימודי־חווייתי לקבוצות המעוניינות לעצור יחד, ללמוד ולחקור כיצד ניתן לקיים יחסים של שיתוף פעולה, אמון וקשב הדדי, תוך התנסות יומיומית בעבודה משותפת בלב המדבר.

ההשתתפות פתוחה לכל אדם או קבוצה המעוניינים בלמידה דרך התנסות, עשייה ושיח חי. אין צורך ברקע קודם – רק ברצון כן להקשיב, ללמוד ולפגוש את עצמך ואת האחרים.

החוויה במדרשה משלבת לימוד, שיח, עשייה משותפת והתבוננות שקטה בתוך חיי היום־יום של נאות סמדר. השהות במדבר מאפשרת מפגש עמוק, פשטות וחיבור מחודש לאדם ולטבע.